对于fragment counts建模可改善单细胞 ATAC-seq 分析（而非read counts/binary counts）：

https://www.nature.com/articles/s41592-023-02112-6

提出了改进scATAC-seq counts matrix的PIC方法，能够提供对scATAC-seq更准确的定量矩阵，并改进下游分析

https://www.nature.com/articles/s41592-023-02103-7

方法链接：https://github.com/Zhen-Miao/PICsnATAC